Если вы хотите раскрасить части вашего рисунка разными цветами, то перед тем, как начать раскрашивание, щелкните на кнопке Transparent Pixels (Прозрачные пикселы) на палитре Layers
He забывайте раскрашивать и слой Rough Graphic, и слой Extra Texture.